專為運輸要求保持一定溫度的冷凍貨或低溫貨而設計的集裝箱。它分為帶有冷凍機的內藏式機械冷藏集裝箱和沒有冷凍機的外置式機械冷藏集裝箱。適用裝載肉類、水果等貨物。冷藏集裝箱造價較高，營運費用較高，使用中應注意冷凍裝置的技術狀態及箱內貨物所需的溫度。
冷藏集裝箱運送凍結貨時通常使用溫度應不-18℃。通常英尺冷凍集裝箱，平均降溫速度為31.3℃ /h（空箱）；但裝貨后，由于貨物熱容量較大，降溫速度會大大減慢，有時達到設定溫度要求需要15-16h。若進貨溫度較高，則達到設定溫度需要2-3天。
人們常用二手冷藏集裝箱運輸和保存易腐蝕貨物（蛋白質制品或新鮮水果和蔬菜）。在日常使用中，很多人稱它為“凍柜”，誤認為它跟家用冰箱一樣，可以在短時間內完全冷凍貨物并長時間保持。實際上，這種認知是錯誤的，只對了其中一半。
